中國科技大學(xué)課件系列生物信息學(xué)

1、第 三 章 序 列 比 對(duì) r第 一 節(jié) ： 數(shù) 學(xué) 基 礎(chǔ) ： 概 率 及 概 率 模 型r第 二 節(jié) ： 雙 序 列 比 對(duì) 算 法 的 介 紹Dot matrix動(dòng)態(tài)規(guī)劃算法wNeedlemanWunsch, SmithWaterma。

2、生物信息學(xué) 第三章 序列比對(duì) 本章內(nèi)容提要 第一節(jié)：數(shù)學(xué)基礎(chǔ)：概率及概率模型 第二節(jié)：雙序列比對(duì)算法的介紹 Dot matrix 動(dòng)態(tài)規(guī)劃算法 (Needleman-Wunsch, Smith-Waterman算法 ) FASTA和 BLAST算法 第三節(jié)：打分矩陣及其含義 第四節(jié)：多序列比對(duì) 第三節(jié) 打分矩陣及其含義 1，計(jì)分方法 2， Dayhoff: PAM系列矩陣 3， Henik。

3、第二章：序列的采集和存儲(chǔ) DNA：Deoxyribonucleic acid，脫氧核糖核酸；RNA：RiboNucleic Acid，核糖核酸； r1. DNA測(cè)序r2. 序列數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)核酸序列數(shù)據(jù)庫蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫基因組數(shù)據(jù)庫r3. 序列。

4、生物信息學(xué),第三章 序列比對(duì) ,本章內(nèi)容提要,第一節(jié)：數(shù)學(xué)基礎(chǔ)：概率及概率模型 第二節(jié)：雙序列比對(duì)算法的介紹 Dot matrix 動(dòng)態(tài)規(guī)劃算法 (Needleman-Wunsch, Smith-Waterman算法) FASTA和BLAST算法 第三節(jié)：打分矩陣及其含義 第四節(jié)：多序列比對(duì),第三節(jié) 打分矩陣及其含義,1，計(jì)分方法 2，Dayhoff: PAM系列矩陣 3，Henikoff: BL。

5、第一章：概論 r人類基因組計(jì)劃Human Genome Project, HGP：1990年正式啟動(dòng)，旨在完成人類基因組約30億個(gè)堿基的全序列測(cè)定。r 海量生物數(shù)據(jù)的迅速膨脹：DNARNA和蛋白質(zhì)序列，蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)和三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)，蛋白質(zhì)相。