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1、關(guān)于pKa,寇朝衛(wèi) 2013.09.24,Mainly from (美)克恩斯,邸力著;鐘大放等譯. 類藥性質(zhì):概念、結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)與方法 從ADME到安全性優(yōu)化.科學(xué)出版社,2011.01.,摘要,1 pKa顯示一種化合物的離子化能力。離子化能力是決定溶解度和滲透性的主要因素。 2 當(dāng)pH=pKa時(shí),溶液中離子化分子與中性分子濃度相同。 3 隨著pKa增加,堿性化合物的堿性增強(qiáng);酸性化合物的酸性則隨著pKa降低,對(duì)于2如電離方程式為HA H(+)+A(-),則電離常數(shù)Ka=H+*A-/HApKa=-log(Ka)那么pH與pKa的關(guān)系是:pKa=PH值log(未解離濃度已解離濃度),,From論
2、壇 ,如右圖所示,絕大部分化合都含有可離子化基團(tuán)(圖61)。 大部分呈堿性,一些呈酸性,僅5不能離子化。pKa顯示一種化合物的離子化能力,它是分子中基團(tuán)的酸性或堿性的函數(shù)?;瘜W(xué)家通過(guò)修飾化合物骨架的酸性或堿性亞結(jié)構(gòu)以獲得理想的pKa從而改變其溶解度和滲透性。,目錄,1 pKa的基本原理 2 pKa的影響 3影響有機(jī)物pKa的因素 4 pKa案例研究 5針對(duì)pKa的結(jié)構(gòu)修飾策略,1 pKa的基本原理,當(dāng)pH=pKa時(shí),溶液中離子化分子與中性分子濃度相同。,隨著pKa增加,堿性化合物的堿性增強(qiáng);酸性化合物的酸性則隨著pKa降低,2 pKa的影響,在水溶液中,離子化分子比中性分子的溶解度高,原因在于
3、離子的極性更強(qiáng)。 溶解度包括中性分子的固有溶解度和離子形式的溶度,且后者遠(yuǎn)高于前者。與此相反,離子化分子的滲透性比中性分子低。中性分子比離子化分子的親脂性高得多,以被動(dòng)擴(kuò)散方式完成的滲透主要是通過(guò)中性分子形式。 由于pKa決定了離子化程度,所以它對(duì)溶解度和滲透性均有很大影響,從而會(huì)影響水中污染物質(zhì)的膜吸收。離子化效應(yīng)顯示了膜處理中經(jīng)常遇到的一種關(guān)聯(lián)性:滲透性高的化合物通常溶解度低,反之亦然。因?yàn)殡x子化對(duì)這兩種性質(zhì)有著相反的影響,因此需要在溶解度和滲透性之問(wèn)進(jìn)行權(quán)衡。,pKa也影響某些結(jié)構(gòu)系列的活性,據(jù)推測(cè),這與靶蛋白活性位點(diǎn)的相互作用發(fā)生改變有關(guān)。,3影響有機(jī)物pKa的因素,物質(zhì)的pKa值受
4、分子外部因素和內(nèi)部因素的影響。外部因素包括溶劑環(huán)境(溶劑極性、離子強(qiáng)度等)和溫度;內(nèi)部因素則是指分子組成及結(jié)構(gòu)帶來(lái)的誘導(dǎo)效應(yīng)、場(chǎng)效應(yīng)、共振效應(yīng)、氫鍵影響、立體效應(yīng)以及雜化作用等。這里重點(diǎn)討論分子組成及結(jié)構(gòu)對(duì)物質(zhì)pKa值的影響。,From 戴猷元,秦?zé)槪瑥堣染幹?有機(jī)物絡(luò)合萃取化學(xué).化學(xué)工業(yè)出社,2008.5.,(1) 誘導(dǎo)效應(yīng) 吸電子基,如鹵素,能使HA鍵減弱,并能穩(wěn)定陰離子,從而使酸性強(qiáng),pKa減小。當(dāng)分子中吸電子取代基數(shù)目增加時(shí),誘導(dǎo)效應(yīng)也增強(qiáng),分子的酸性增強(qiáng)。供電子基,如烷基、氨基,能增強(qiáng)HA鍵,從而增加對(duì)質(zhì)子的親和力,這將使堿性增加,pKa增大。 (2) 場(chǎng)效應(yīng) 場(chǎng)效應(yīng)是通過(guò)空間而不
5、是通過(guò)成鍵起作用的電子效應(yīng)。對(duì)于多數(shù)分子來(lái)說(shuō),區(qū)分誘導(dǎo)效應(yīng)和場(chǎng)效應(yīng)是很不容易的,因?yàn)槎邥r(shí)常同時(shí)作用,而且對(duì)物質(zhì)酸性強(qiáng)弱的影響是一致的。一般常把誘導(dǎo)效應(yīng)和場(chǎng)效應(yīng)合并考慮,當(dāng)作為“極性效應(yīng)”。 (3) 共振效應(yīng)官能團(tuán),如pNO2,通過(guò)減弱OH鍵并使陰離子穩(wěn)定,可使苯甲酸或苯酚的酸性增加;官能團(tuán),如NH2,通過(guò)共振提供電子,因此,會(huì)增強(qiáng)OH鍵,促進(jìn)陰離子和質(zhì)子的結(jié)合,所以,酸性會(huì)相應(yīng)減弱。 (4) 氫鍵在分子內(nèi)部形成氫鍵能夠在很大程度上影響酸性的強(qiáng)弱。例如:鄰羥基苯甲酸由于OH和COOH間形成了氫鍵,電荷離域化,穩(wěn)定性增強(qiáng),結(jié)果增大了分子的酸性。 (5) 立體效應(yīng) 由于質(zhì)子較小,質(zhì)子酸堿反應(yīng)對(duì)立體
6、壓縮不太敏感。然而,具有較多分支的酸,其陰離子會(huì)由于較小的溶劑化程度變得不太穩(wěn)定,導(dǎo)致酸性減弱。,From 戴猷元,秦?zé)槪瑥堣染幹?有機(jī)物絡(luò)合萃取化學(xué).化學(xué)工業(yè)出社,2008.5.,4 pKa案例研究,,,,圖64顯示了pKa和分子大小對(duì)一個(gè)結(jié)構(gòu)系列化合物活性影響的例子。哌啶的pKa約為10,脂肪族基團(tuán)的修飾對(duì)其pKa幾乎沒(méi)有影響。當(dāng)修飾基團(tuán)逐漸增大時(shí),似乎會(huì)引起部分失活。雖然芳香環(huán)與其他修飾基團(tuán)對(duì)于化合物體積的改變基本一致;然而,當(dāng)引入芳香環(huán)后,胺的堿性大幅下降,從而導(dǎo)致其活性遠(yuǎn)低于預(yù)期。,IC50是指被抑制一半時(shí)抑制劑的濃度,該濃度稱為50%抑制濃度,即凋亡細(xì)胞與全部細(xì)胞數(shù)之比等于50%
7、時(shí)所對(duì)應(yīng)的濃度。IC50值可以用來(lái)衡量化合物誘導(dǎo)凋亡的能力,即誘導(dǎo)能力越強(qiáng),該數(shù)值越低,當(dāng)然也可以反向說(shuō)明某種細(xì)胞對(duì)藥物的耐受程度。,,,,,,,4針對(duì)pKa的結(jié)構(gòu)修飾策略,當(dāng)計(jì)劃通過(guò)合成修飾改善一種結(jié)構(gòu)系列化合物的水溶性或滲透性時(shí),可選擇多種亞結(jié)構(gòu)。但必須記得,提高溶解度的結(jié)構(gòu)修飾也將會(huì)降低化合物的滲透性。 根據(jù)預(yù)期效果不同,可通過(guò)引入或除去供電子和吸電子基團(tuán),以提高酸性或堿性化合物的電子密度。例如,可在位引入鹵素或其他吸電子基團(tuán)(例如羧基、氰基、硝基)提高酸性化合物的酸性,但引人脂肪基團(tuán)則影響很小。除去吸電子基團(tuán)后,可降低其酸性強(qiáng)度。,,引入芳香基可降低堿性化合物的堿性強(qiáng)度(例如苯胺)。孤電子對(duì)離域后,與芳香環(huán)形成共軛體系。引入脂肪基團(tuán)后,堿性也會(huì)小幅降低。由于甲氧基可提供電子,引入該基團(tuán)后能提高苯胺的堿性;若引入吸電子的硝基,則苯胺的堿性下降。,