哈佛大學(xué)公開(kāi)課程-蛋白質(zhì)和DNA的關(guān)系.ppt
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免疫學(xué)信息網(wǎng) Protein DNAInteractions EquilibriaandfreeenergiesEstimatebindingsiteoccupancyForcesdrivingprotein DNAinteractionsLambdarepressorMethodstostudyprotein DNAinteractions 免疫學(xué)信息網(wǎng) A A A A D D H 1 免疫學(xué)信息網(wǎng) A A D M Major A T A A D M T A Minor A T T A A A A A A A D H G C C G G C C G Major H D A A A A D A A D Minor The4MajorGroovePatternsAreDistinct 2 免疫學(xué)信息網(wǎng) A A A A D D H 1 HyrdophobicGroupsonBases 免疫學(xué)信息網(wǎng) 3 Helix Turn HelixMotif 34A 免疫學(xué)信息網(wǎng) 3 4 1 2 5 N term 3 4 免疫學(xué)信息網(wǎng) 免疫學(xué)信息網(wǎng) 6 免疫學(xué)信息網(wǎng) Gln33NetworkswithGln44 Ser G 4 5kcal Leu G 6 2kcal 7 免疫學(xué)信息網(wǎng) Conclusion DNAbindingspecificityfrommajorgrooveinteractionsMutationinoneAAaffectsneighbors Protein DNAinterfacescontainanintricateNetworkofhydrogenbonds 免疫學(xué)信息網(wǎng) BDNA 434Complex 9 4basesdon tcontactproteinButveryImportant 免疫學(xué)信息網(wǎng) FilterBinding vacuum Bound Protein nM 020406080100 100 50 Kd 20nM 10 免疫學(xué)信息網(wǎng) Immunoprecipitaiton Bound Protein nM 020406080100 100 50 Kd 20nM 10 A Sepharose 免疫學(xué)信息網(wǎng) Gel Shift Shifted Protein nM 020406080100 100 50 Kd 20nM Protein 11 免疫學(xué)信息網(wǎng) DNAseIFootprinting Protected Protein nM 020406080100 100 50 Kd 20nM Protein DNAseI 12 免疫學(xué)信息網(wǎng) CooperativeDNAbindingBythe repressor 13 免疫學(xué)信息網(wǎng) InterferenceFootprinting DNA MMS Saturating Protein GelShift 14 免疫學(xué)信息網(wǎng) ElectronMicroscopy 15 免疫學(xué)信息網(wǎng) YFP Tilt Roll Tilt Roll 19 Tilt Roll 免疫學(xué)信息網(wǎng) InteractionofTBP TATABindingProtein WithDNA MajorGroove MinorGroove 17 免疫學(xué)信息網(wǎng) Protein InducedDNABendingFromPositiveRoll 18 5 3 免疫學(xué)信息網(wǎng) Pyrimidine PurineStepsHaveLittleBaseStacking 19A Lecture1 免疫學(xué)信息網(wǎng) Foradvancedreading NucleicAcids Structures Properties andFunctionsV A BloomfieldD M CrothersI Tinoco 免疫學(xué)信息網(wǎng) 8 Gln G 5 2kcal Lys G 4 1kcal- 1.請(qǐng)仔細(xì)閱讀文檔,確保文檔完整性,對(duì)于不預(yù)覽、不比對(duì)內(nèi)容而直接下載帶來(lái)的問(wèn)題本站不予受理。
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